慢性结肠炎的患者，需要根据患者的具体临床症状进行药物治疗，其药物治疗应当分为急性期治疗和缓解期的一般治疗。在急性期因为出现腹泻会导致脱水，需要及时纠正水电解质紊乱，便血的患者由于出现贫血还应当进行输血和补充白蛋白。药物治疗可以使用美沙拉嗪，蒙脱石散以及阿托品，山莨菪碱，硝苯地平，以及多潘立酮，莫沙必利等等。对于便秘的患者可以适当使用开塞露，果导片。