发生肛周脓肿的时候初期的症状往往是疼痛，如果是到了晚期已经化脓疼痛症状会出现明显的减轻。肛周脓肿的患者局部还会出现红肿现象，有的时候患者可以出现发热，通常低热比较多见一些，但是有的时候也有可能会出现高热。此外，肛周脓肿初期的时候患者还有可能会出现一些全身的症状，比如说全身倦怠不适，食欲不振，有的时候由于疼痛还会引起睡眠不佳等。由于脓肿出现的具体位置不同，症状也有少许的不同，如果是深部脓肿还有可能会伴有会阴或者是腰骶部的疼痛。如果是直肠黏膜下脓肿以及括约肌间脓肿可能仅仅表现为肛门的疼痛，还可以有排尿困难或者是里急后重的感觉。