结肠炎的症状主要是腹泻、腹痛以及在大便的时候有里急后重感。患者腹泻的次数每天能达到三到五次，严重的能达到十余次，并且会出现血水或黏液脓血便。腹痛多位于脐周和下腹，症状比较轻时，部分患者仅有下腹部不适，没有明确的腹痛，在排便以后腹痛会有所减轻。部分患者会伴随不同程度的发热、腹胀、食欲减退。长期的慢性结肠炎，如溃疡性结肠炎反复发作，会导致患者出现贫血、低蛋白血症、消瘦以及焦虑、失眠、多梦的症状。严重患者会出现麻痹性肠梗阻或中毒性巨结肠、穿孔、大出血表现。有些患者甚至伴有肠外表现，如口腔溃疡、关节炎、眼炎、皮肤结节性红斑等。