甲肝病毒感染后，多数患者无明显临床症状，以隐性感染为主。部分患者表现为急性发病及畏寒、发热、腹痛、腹泻、乏力、恶心、呕吐、肝脏肿大为主要症状。部分患者表现为肝功能异常，转氨酶升高幅度达800至2000U/L不等，占总体患者的55%。急性发病人群中，83%的患者出现发热，体温在38至39摄氏度，病程多在三天之内，其中15%的人群发热时间超过五天。部分患者以黄疸为表现，最初起病与感冒相似，常被误认为感冒而耽误治疗。