正常人体精液中也存在异常的精子，一般所占百分率第30%。如果畸形的精子百分率高于50%，则称为高畸形率精子，可以导致不育，引起精子畸形的原因有很多，比如泌尿生殖道的感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核精索静脉曲张等。使用激素或者某些化学药物。如抗癌药、利血平、马利兰、呋喃类等，可以使得精子发育不成熟。生殖腺受到放射性的照射，可以引起精子的突变阴囊局部长期高热，长期酗酒均可以使精子发生畸形，畸行精子超过70%，应进行染色体的检查。所有染色体病治疗则比较困难。经验中有支原体感染时精子活动率降低精子密度减少畸形精子也会增多。