在药物治疗方面，由于反流性食管炎常见直接损伤因素为胃酸及胃蛋白酶，抑制胃酸成为基础治疗。质子泵抑制剂抑酸作用强，疗效确切，是治疗反流性食管炎的首选药物。通常疗程4到8周，对重度食管炎以及合并食管裂孔疝的病人，可以适当延长疗程或者增加质子泵抑制剂的剂量。促胃肠动力药可以增加下食管括约肌压力，改善食管蠕动功能，促进胃排空，从而减少胃十二指肠内容物反流，并缩短食物在食管的暴露时间，可以用于轻症病人或者辅助抑酸药联合使用。反流性食管炎治疗目的在于控制症状，治愈食管炎，减少复发和防治并发症