腰酸伴小腹隐隐作痛主要原因如下：第一，如果是女性患者出现腰酸、小腹隐痛，考虑是由于妇科疾病所引起，例如当盆腔炎发病的时候，会出现以上的症状。发病后主要通过中医、中药调理、抗感染治疗等改善病情。第二，肾结石。本病发病的时候会出现腰部酸痛，伴有小腹隐痛等症状，可通过泌尿系超声检查等明确诊断。确诊后病情不明显可观察病情，必要的时候可通过超声波碎石治疗，或手术治疗改善病情。当出现腰部隐痛伴有小腹疼痛的症状，是应到医院门诊就诊，通过系统检查明确诊断对症治疗。