体外克隆目的基因方法有很多，目前用于获得目的基因的方法有几种，如：限制性内切酶、直接分离法、文库筛选法、体外扩增法和人工合成法等，其中限制性内切酶法直接分离目的基因和多聚酶链式反应（PCR），或逆转录多聚酶链式反应（RT-PCR）体外扩增目的DNA片段是目前最常用的方法。将基因组DNA用限制性内切酶消化后插入到适当载体中，得到含有不同插入片段的克隆载体，这种克隆载体的混合物含有长短不同的基因组片段，这就是基因文库。