蹲的时间长了，引起膝盖疼，一般最常见的原因就是长时间的蹲着，导致膝关节周围的肌肉软组织发生劳损，进一步引起疼痛。还有一种原因就是过度屈曲膝关节使半月板长时间缺血进一步导致损伤。一般来说，如果疼痛比较轻的话，可以注意休息，避免过度活动劳累，避免长时间的蹲着，然后再蹲的时间十分钟以后可以适当的进行膝关节的屈伸运动，同时可以做一些膝关节的康复理疗的相关治疗，比如说推拿、按摩、热敷等等。如果疼痛症状比较严重的话，应该立即停止蹲着，然后站起来，继续卧床休息。最好去医院做进一步的检查，比如说做核磁共振检查，明确膝关节的韧带、半月板、软骨等等，有没有什么器质性的损伤。如果说没有器质性的病变，那么可以口服一些活血化瘀的药物，比如说藤黄健骨片、独一味丸等等，还可以口服一些软骨保护的药物，比如说氨基葡萄糖胶囊、玻璃酸钠注射液等等，同时还可以佩戴膝关节的护具进行保护，护具可以限制膝关节的活动，促进膝关节周围软组织劳损的恢复，减轻疼痛。