奥美拉唑肠溶片常见的不良反应为腹泻、恶心、头痛、呕吐、便秘、腹胀、腹痛。偶可见头晕、嗜睡、乏力、睡眠紊乱、感觉异常、瘙痒、皮疹、荨麻疹、肝功能异常等。极个别患者可出现多汗、周围血管性水肿、低钠血症、发热、过敏性休克、血管水肿、白细胞减少症、血小板减少症、全血细胞减少症、粒细胞缺乏症、可逆性精神错乱、异动症、抑郁、攻击和幻觉。男性乳房增生、口干、味觉异常等。