手大拇指关节疼的主要临床原因包括：拇指关节扭伤、外伤导致软组织损伤，甚至骨折会导致手大拇指关节疼。过度活动引起了关节炎、腱鞘炎等炎症会导致手大拇指关节疼。患者患有类风湿性关节炎、风湿、痛风、系统性红斑狼疮等疾病，会导致手大拇指关节疼。长期接触凉水容易发生拇指间关节骨性关节炎，也会出现拇指间关节肿胀及疼痛症状。患者有颈椎病，当颈椎压迫神经根时，会导致手大拇指关节疼。腕管综合征也会导致手大拇指关节疼。