造成阴茎疼痛的原因是非常多的，比较常见的有以下几大类的：1.感染性疾病。如果有存在泌尿系统感染，比如说尿道炎，膀胱炎以及前列腺炎，还有生殖系统感染，比如附睾炎，睾丸炎等等疾病，都有可能会造成阴茎疼痛的。2.结石性疾病。如果有存在膀胱结石，尿道结石，这些结石有可能会刺激尿道粘膜，进而有可能会造成疼痛。3.肿瘤性疾病。如果有膀胱癌，阴茎癌，前列腺癌等等肿瘤性疾病，也会有剩饭周围器官造成阴茎疼痛的表现。