阴茎长水疱可能的原因如下：1、疱疹病毒感染，此病通过性接触传播，治病以后可以发现阴茎上的水疱簇状分布，水疱体积较小，并且疱液自发性破裂以后可以形成局部的糜烂面，伴有明显的疼痛、红肿，需要进行疱疹病毒的检查进一步确诊。2、存在包皮炎、龟头炎等，都可以在包皮、龟头等相应部位出现水疱，水疱进一步进展还可伴有脓疱，破裂以后可以出现局部的糜烂，还可以出现包皮、龟头红肿，或者出现局部红斑，伴有裂口、渗出等改变。需要进行相关病原菌的检测，如细菌涂片检测、真菌涂片检测或者滴虫等相关检测。3、当阴茎包皮局部受到机械性的刺激，如挤压或者受到创伤，或者过度手淫、过度摩擦等，可出现皮肤上的张力性水疱，水疱多为单发，疱液比较清亮，都存在明确的刺激因素或者受伤的病史。