慢性肠炎是指一种慢性长期的反复发作的疾病，主要见于细菌，真菌病毒等微生物感染，此外自身免疫等因素也会导致慢性肠炎。对于慢性肠炎的治疗，首先对于细菌感染导致的慢性肠炎，应积极地给予抗生素治疗，例如头孢菌素，喹诺酮类抗生素，红霉素等。而真菌感染建议积极抗真菌治疗。此外，对于肠痉挛的人来说，可给予解痉止痛的药物，例如阿托品，山莨菪碱。腹泻严重的患者可给予蒙脱石散止泻。