咽喉癌到目前为止，发病病因仍不清楚，考虑吸烟、饮酒、环境因素、病毒感染，微量元素缺乏等原因有关系。吸烟被认为是咽喉癌发生的独立的危险因素，吸烟年龄越小，吸烟的时间越长，发生咽喉癌的可能性越大，长期慢性的酒精摄入也与咽喉癌的发生有一定关系，人乳头状瘤病毒感染是导致咽喉癌的可能的病因，环境因素中有较多的致癌物质或者粉尘接触，还有一些微量元素缺乏、遗传因素都有可能与咽喉癌的发生有关。