慢性肠炎首选的药物治疗是益生菌，常用的益生菌有：酸梭菌活菌片、凝结芽孢杆菌、枯草杆菌胶囊等，可以单药使用或者是双药联合用于治疗慢性肠炎。对于电子结肠镜下明确有肠道黏膜糜烂或者是有明显的充血水肿的患者，也可以联合促进肠道黏膜修复的药物治疗，如常用的有康复新液或者是马来酸伊索拉定等。另外，建议患者平时生活中要注意养成良好的饮食习惯和良好的作息习惯，不抽烟不喝酒，保持心情愉快，避免暴饮暴食，避免高脂肪饮食等，平时也要定期复查电子结肠镜。