肾上腺皮质激素的副作用有促进蛋白质分解和抑制蛋白质的合成，产生负氮平衡；可增加钙磷代谢，同时有抗维生素D的作用，以至影响钙的吸收；长期应用还可抑制骨细胞的活力，使骨质形成发生障碍，可致骨质疏松，甚至发生骨折。另外，肾上腺皮质激素有对抗生长激素的作用，能抑制骨骼生长及蛋白质合成。长期较多量应用肾上腺皮质激素会发生库欣综合征，会影响小儿的生长发育，造成矮小。肾上腺皮质功能萎缩或功能不全者慎用。