女性小便时肚子疼需要明确一下疼痛的具体部位，持续的时间，诱发和缓解的因素，是否有尿频，尿急，尿血，发烧，白带异常等情况。而临床上导致这种情况的病因，常见的有泌尿系感染，结石，结核、肿瘤以及妇科疾病累及到尿道或者是膀胱等。建议可以暂时观察，如果疼痛时间长，不能自行缓解时，需要及时到医院就诊，让专业的医生体检一下，医生会根据具体的情况，采取相应的检查，明确后治疗，平时需要注意保暖，不能受凉。