对于晚期甲亢的治疗，首先要根据患者的甲状腺功能以及合并的甲亢相关的并发症，去进行具体的方案的制定。因为此时的甲状腺功能异常比较明显，所以注意不能停用抗甲状腺的口服药物。针对一些并发症，如甲亢相关性的眼病，要注意排除禁忌之后，进行激素的治疗。建议最好在医院去进行。然后如果是甲亢性心脏病，建议选择一些针对心脏的药物去进行治疗。