目前并没有直接证据显示咖啡因会导致骨质疏松症，且某些研究发现，咖啡因虽会增加钙质排泄，但并非造成骨质疏松的高危险因素，钙质的摄取不足才是主要原因，因此仍建议应该注意钙质的充分摄取。咖啡对血脂肪、血压、心脏病与癌症的发生率，目前研究人员还没有足够证据显示咖啡因相关性。喝咖啡过量虽然可能会妨碍胎儿的发育，但未能证实是否会导致早产或婴儿出生体重不足。不过仍然奉劝孕妇少喝咖啡为妙，因已有够多的研究指出咖啡因会

降低妇女受孕的机会，增加流产的风险，阻缓胎儿的发育。