阴茎根部长个肉疙瘩，则建议到医院进行相关的检查，明确具体的原因。1、尖锐湿疣，可以好发在阴茎、包皮、龟头、冠状沟或呈会阴区等多处的皮肤，表现为局部不光滑的结节，呈乳头样或者菜花样，表面可以出现出血或者分泌物等，伴有恶臭的气味。多与不洁的性接触，感染人乳头瘤状病毒有关。需要进行局部切除，切除以后进行病理检查。病理检查确诊以后，还需要进行抗病毒治疗。2、梅毒硬下疳，通过不洁的性接触感染梅毒以后，出现局部的溃疡。用手触摸时质地较硬，呈表面凸起骨化样的改变，需要进行梅毒抗原抗体的检测，进一步确诊。必要时需要进行局部切除，进行病理检查。如确诊为梅毒，则需要使用苄星青霉素或者长效青霉素制剂，进行规范的治疗。