临床安全性研究发现，少数患者服用昆仙胶囊后，出现恶心，胃部不适，胀痛，胃痛，便秘等症状。极少数有出现皮疹等过敏反应。偶尔有出现色素沉着、口干等副作用。严重的有出现肝功能轻度异常、白细胞减少的现象。少数女性患者出现月经紊乱，出现月经延迟闭经的现象，男子出现精子减少的现象。饭后服用可以减少胃不适的副作用，过敏体质者慎重使用，可以减少过敏现象的发生，如果出现肝功能异常，需要停药并进行保肝护肝治疗。用药过程中定期的随诊、肝肾功能定期的监测，有助于及时发现药物副作用并进行及时的处理。