子宫内膜异位症的治疗目的是缩减和去除病灶，减轻和控制疼痛，治疗和促进生育，预防和减少复发。治疗方法应根据患者年龄，症状，病变部位和范围以及对生育要求等加以选择，加强治疗个体化。症状轻或无症状的轻微病变可选择期待治疗，有生育要求的轻度患者经过全面诊断评估后，可以先给予药物治疗，重者行保留生育功能手术，年轻无生育要求的重度患者可行保留卵巢功能手术，并辅以激素治疗。