肛周脓肿的手术方式，目前在临床上最常用的就是一次性根治术或者一次性根治挂线术。主要是针对一些内口比较明确的肛周脓肿，可以在脓腔切开引流时，将内口一并打开，以防止术后出现肛瘘，而避免二次手术。而对于一些在切开引流时内口并不明确的肛周脓肿，一般就单纯的行切开引流，大部分的患者会在术后形成肛瘘，可以选择三个月以后再行肛瘘根治性手术。而极少的患者有可能不会形成肛瘘，也不需要行二次的肛瘘手术。