慢性扁桃体炎一般治疗主要是针对于病情来明确，大多数患者出现有急性发作时，处理原则和治疗急性扁桃体一致，主要是针对于有细菌感染时，给予敏感的抗生素，选择青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类、喹诺酮类，有厌氧菌感染时，可以选择抗厌氧菌的药物，并且体温超过38.5摄氏度以上时使用退热剂。比如布洛芬，对乙酰氨基酚、双氯芬酸钠、阿司匹林等，还可以给予一些清热解毒的中成药，比如清热解毒胶囊、鱼腥草糖浆、蓝芩口服液等。在慢性扁桃体炎的缓解期，还可以适当的给予一些雾化吸入的治疗的药物，能够防止炎症加重和复发，而且期间还可以适当的服用一些增强免疫力的药物，比如玉屏风等。