目前尚没有有效的治疗HPV感染的方法，现有的办法主要是去除可见的疣体，并减少复发。具体的治疗方法有以下几种：第一，局部治疗。可以给予患者外用5%咪喹莫特霜、5%氟尿嘧啶软膏。第二，物理治疗。可以应用激光、冷冻、电刀、电针等方法，对于疣体巨大的还可用手术切除。第三，氨基酮戊酸光动力疗法。该方法目的是选择性杀伤增生旺盛的细胞，不仅对肉眼可见的疣体有破坏作用，还可清除亚临床损害和潜伏感染组织。第四，免疫疗法。常与其他治疗方法联合使用，可给予患者干扰素、白介素二、聚肌胞等药物。尖锐湿疣治疗方法的选择还取决于具体皮损的分布部位、大小、数目、形态、治疗费用、患者的选择、方便性、副作用及医生的经验。大多数患者的治疗是一个长期的过程，而不是一次性的治疗，针对每一位患者应该都有一个长期的治疗计划。