目前根本病因尚未完全明确，认为本病的发生与遗传、感染和免疫因素有关。第一、与遗传因素关系密切，强直性脊柱炎的患者90%HLA-B27呈阳性，HLA-B27阳性的人有10%会发生强直性脊柱炎，而且强直性脊柱炎患者的一级或二级亲属也常常会发病，因此该病有遗传易感性。第二、与感染因素有关，强直性脊柱炎是脊柱关节病的一种，脊柱关节病中的反应性关节炎是由感染引发的，由此推断强直性脊柱炎的发病可能和感染有关性，感染可能是诱发因素。第三、免疫因素，强直性脊柱炎是自身免疫性结缔组织病，自身的免疫紊乱导致炎性因子释放攻击身体的组织和器官，引起关节附着点的炎症反应，最终导致疾病发生。