多发肾结石的治疗比较复杂，要根据结石的多少和大小来决定，如果结石在六毫米以下的，可以先采取保守的治疗方法，同时输尿管和尿道还必须没有梗阻，保守治疗方法包括多饮水，吃一些松弛输尿管以及促进排石的药物，比如说哈乐，6542，排石颗粒等等。如果结石处于六毫米和两厘米之间，可以采用体外冲击波碎石的方法，如果结石比较大，负荷量较大的结石，采用输尿管软镜碎石，这是近期兴起的一个新的一个治疗方案。比较有利于患者的结石的彻底的碎石和排除，对于两厘米以上的大结石，或者结石，负荷量较大较多的'采取经皮肾镜碎石取石术，有些结石甚至要进行多次碎石。