三个月婴儿感冒咳嗽流鼻涕，可以根据孩子流鼻涕的情况，如果孩子是流清鼻涕的现象，说明是属于病毒性的感染，可以选择应用抑制病毒蛋白质合成的药物，或者抑制病毒遗传物质合成的药物进行治疗，也可以应用抑制病毒与正常细胞结合的药物进行治疗。如果是属于细菌性的感染，可以表现为咳嗽，流黄鼻涕比较黏稠，可以选择应用青霉素类的抗生素，或者头孢菌素类的抗生素或者大环内酯类的抗生素。