肛瘘是一种常见的疾病，在中医上认为，肛瘘主要是由于肛痈溃后久不收口，湿热余毒未尽。有时西医认为肛瘘是肛门直肠周围脓肿的后遗疾患，肛周脓肿成脓以后，经肛周皮肤或者肛管直肠黏膜破溃，脓液充分引流后，脓腔随之逐渐缩小，脓腔壁结缔组织增生，脓腔缩窄，形成或弯或直的管道，即为肛瘘。有时结核、放线菌等特殊感染也会导致肛瘘的形成。如果细菌入侵肛腺，肛窦感染以后导致肛腺管开口充血水肿，肛腺内分泌物排出不畅，从而引起感染扩散。尤其是肛管后侧是肛腺相对集中及大便时冲击力最大的区域，所以临床上肛管后侧肛瘘最为常见。