增生型肠结核确诊以后，主要给予抗结核化疗药物治疗。治疗的目的是为了消除症状，改善全身情况，促进病灶愈合及防治并发症，早期治疗肠结核的病变是可逆的。如果患者腹痛严重，可用抗胆碱的药物。如果出现不完全性肠梗阻，需要进行胃肠减压。如果发生完全性肠梗阻或不完全性肠梗阻经内科治疗无效，需要手术治疗。如果增生型肠结核发生慢性穿孔、瘘管形成，也需要外科手术治疗。