阴茎的左边根部位疼痛，考虑与手淫、性生活过度、不洁的性生活有关。手淫是不良的习惯，长期手淫对身体的伤害比较大，还会对阴茎部位造成刺激。如果手淫时用力过猛，可能导致局部的组织损伤，容易引起疼痛。另外，过度的性生活对身体的健康不利，如果性生活过于频繁，会导致男性出现阴茎不适，个别患者还会有疼痛的症状。除此以外，阴茎左边根部疼痛，也可考虑与不洁的性生活有关，比如细菌对局部造成感染时，也会引起疼痛。需要就诊于医院的男科，了解引起疼痛的原因，如果是细菌感染引起的，可以给予抗感染的药物治疗。