肾脏两侧酸痛的原因，需要分析不同的情况来鉴别诊断，因为肾区有皮肤、肌肉、骨骼以及肾脏，具体如下：1、皮肤：可以出现外伤、蚊虫叮咬以及炎症，往往是疼痛或者刺痛，而不是酸痛；2、肌肉：出现了腰肌劳损往往是酸痛，在体位改变的时候可以加重或者减轻；3、腰椎：例如椎间盘突出和骨质增生可以出现疼痛，疼痛在弯腰提重物的时候可以加重；4、肾脏：例如肾脏出血、积水以及炎症，可以出现肾脏的不适，在泌尿系统彩超上可以明显的得到鉴别诊断。