脑积水的治疗以手术治疗为主，其次可以辅助药物治疗或其他治疗，目的是消除原发病灶，通过脑室分流减轻脑内压力。急性期时，高颅压性脑积水引起视力急剧减退或丧失者，需紧急处理，行脑脊液分流术，不能分流的应进行脑室穿刺持续外引流。手术方式多采用脑脊液分流术，如脑室-心房分流术、脑室-矢状窦分流术、脑室-腹腔分流术等，其中以脑室-腹腔分流术相对安全，并发症少，使用较多。对于中脑导水管狭窄或隔膜形成的患者也可采用脑室镜治疗。一般治疗方法中，重点在于防止脑疝形成，及时脱水降低颅内压，营养神经，积极处理原发病等。药物治疗一般只适用于轻度脑积水，两周岁以内的轻度脑积水首选抑制脑脊液分泌药物，如乙酰唑胺（应用此药物时因用量大应注意其可引起代谢性酸中毒），以及脱水药物和利尿剂，如甘露醇、氢氯噻嗪、氨苯蝶啶、呋塞米。脑积水通过手术治疗和药物治疗常可治愈，术后症状好转、生活质量可明显提高，但也有可能留有并发症，如智力障碍、术后记忆缺失、癫痫、失明等，其严重程度主要取决于疾病对脑组织损伤的严重程度、是否及时进行了适当的治疗。