肠胃功能失调以缓解症状、防止复发为主。平时应改善生活习惯，避免烟酒、咖啡及非甾体类抗炎药。避免个人生活经历中会诱发症状的食物。尽量少食多餐，避免一次大量进食。对腹胀、早饱、嗳气等症状者可用促胃动力药如多潘立酮、莫沙必利，对非进餐相关消化不良中上腹痛、烧灼感可用质子泵抑制剂奥美拉唑兰索拉唑，腹泻者可用洛哌丁胺，针灸能改善部分患者症状和焦虑抑郁状态，按摩推拿可促进胃肠蠕动，改善便秘症状。