眼睛结膜炎的治疗方法，主要是药物治疗。但具体的药物使用情况，还需有主治医生根据结膜炎的具体类型进行制定。如果是超急性细菌性结膜炎，可局部或全身给予相对应的抗生素药物治疗，避免感染进一步加重。如果是急性细菌性结膜炎，可局部给予抗生素滴眼液或药膏。若同时伴有急性化脓性中耳炎、咽炎等异常情况，局部用药期间还需配合口服抗生素。如果是慢性细菌性结膜炎，也需局部或全身给予足量的抗生素治疗。但治疗周期可能会比超急性细菌性结膜炎更长。