锰矿石按矿床成因类型分为沉积型、沉积变质型、风化型铁帽型、热液型玛瑙山锰矿四种。

（1）沉积型

海相沉积碳酸锰矿石：遵义锰矿、湘潭锰矿、花垣锰矿、桃江锰矿、龙头锰矿、松桃锰矿和秀山锰矿等。海相沉积氧化锰-碳酸锰矿石：瓦房子锰矿。海相沉积锰硼矿石：水厂沟锰硼矿。湖相沉积碳酸盐岩类含锰铁矿石、屯留潞安锰矿。

（2）沉积变质型

沉积变质氧化锰矿石：斗南锰矿、白显锰矿、乐华锰矿。沉积变质硫锰-碳酸锰矿石：桃江棠甘山锰矿。

（3）风化型铁帽型

木圭锰矿；堆积型：八一锰矿、东湘桥锰矿、平乐锰矿、荔浦锰矿；淋滤型：木圭烟灰状锰矿石。

（4）热液型玛瑙山锰矿

按工业用途分为冶金用锰矿石和化工用锰矿石（化学工业和轻工业用锰矿石）。

按矿石中铁、锰含量分为锰矿石及铁锰矿石。

按矿石的物质组成和化学成分、结构构造分为碳酸锰矿石、硫锰-碳酸锰矿石、铁锰矿石、氧化锰矿石。

按矿物的自然类型和所含伴生元素分为碳酸锰矿石、氧化锰矿石、混合锰矿石以及多金属锰矿石。碳酸锰矿石中以各种碳酸锰矿物形态存在的锰含量占矿石含锰总量的85％以上。氧化锰矿石中以各种氧化锰矿物形态存在的锰含量占矿石含锰总量的85％以上。混合锰矿石中以各种碳酸锰或各种氧化锰矿物形态存在的锰含量占矿石含锰总量均小于85％。多金属锰矿石其锰矿物类型同前三种锰矿石类型，除锰矿物外，还含有其他金属和非金属矿物。