软件著作权登记变更的手续是：填写软件登记事项变更或补充申请表，准备完整的工商变更通知书、原著作权登记证书、新工商营业执照副本复印件;下载代理委托书，填写软件名称并盖好公章;将以上材料提交给相关部门进行登记变更。

【法律依据】

根据《著作权法》第七条，国务院著作权行政管理部门主管全国的著作权管理工作;各省、自治区、直辖市人民政府的著作权行政管理部门主管本行政区域的著作权管理工作。