六扇门不是一个单独的组织，而是三个司法部门的合称，三个司法部门分别指的是刑部、都察院或者御史台以及大理寺，许多影视作品中提及某角色在六扇门任职，或者把六扇门当作一个独立的部门来描写都是虚构的。

六扇门最早出现在初唐朝时期，当时唐代建立了六部的制度，但是社会上还有很多不安定的因素，在刑部就建立了“六扇门”主要是用于暗中调查隋朝的留存势力并且秘密抓捕，但是随着社会的稳定，该组织也退出了历史的舞台。

到了宋朝时期也有过六扇门，主要职能和唐朝时期差不多，但是不同的是，宋朝时期六扇门属于宋朝皇帝直属，并不属于刑部，作用是为皇上调查和抓捕一些不能上台面的事和人。