小丑鱼通常三个月大就可以繁殖了。这种动物在野外一般都是群居的，一个种群中有一个雌性和多个雄性，当雌雄死亡后，就会有雄性变为雌性。产卵前它会将岩石上的藻类以及污物清理干净，这样就可以作为产卵床，通过在岩石上摩擦腹部，从而将鱼卵一粒粒的产下，雄鱼也用类似的方式进行受精。