生物信息学院成立于2000年。学院立足新一轮智慧医疗、健康信息等科技革命和产业变革，贯彻落实“健康中国2030”规划纲要和面向人民生命健康战略导向，依托“信息技术+专业”办学优势，创新“信息技术+专业”交叉融合，致力培养信息技术与医疗装备、健康产业等领域复合型创新人才。毕业学生具备数字医疗仪器、医学信息软件、生物信息大数据技术等领域的研发、生产和管理能力。学院现有生物医学工程、生物信息学和医学信息工程三个本科专业，生物医学工程和生物学学术学位硕士授权点和电子信息-生物医学工程专业学位硕士授权点，重庆市医用电子与信息技术工程研究中心博士后科研工作站。学院建有重庆市医用电子与信息技术工程研究中心、数字医疗装备与系统重庆市工程研究中心、大数据生物智能重庆市重点实验室3个省部级重点工程研究中心和实验室，省部级联建重点实验室及工程研究中心6个，省部级“智慧医疗”创新团队1个，建有重庆邮电大学重钢总医院附属医院，获批中央与地方共建实验室项目6项。