红鹦鹉鱼是通过人工杂交得来的新品种，它们在生理结构上存在一定的差异缺陷。红鹦鹉鱼的雄鱼不具备生殖能力，鱼卵的染色体不能完整配对，所以雌鱼即使产卵也没办法孵化。因此相同品种的红鹦鹉鱼之间不可以繁殖后代，但是雌性红鹦鹉鱼可以选择和其它品种雄鱼进行交配，繁殖后代。

红鹦鹉鱼通过卵生方式繁殖后代，繁殖时可以让雌性红鹦鹉鱼与雄性的红色红魔鬼鱼或者紫红火口鱼进行交配繁殖。当红鹦鹉鱼产卵后，主人需要用红魔鬼或者紫红火口的雄性鱼为鱼卵受精。繁殖的过程中，雄鱼会先将精子排出。然后，雌鱼会在精子的中央产卵，使部分鱼卵受精。之后，经过受精的鱼卵可以慢慢孵化出小鱼。但是没有经过受精的鱼卵是无法孵化出小鱼的，将它们留在水中会污染水质。因此，在雌鱼产卵后，主人需要及时取出未受精的鱼卵。