花瓣形状不同：马蹄莲的花瓣呈杯形，环绕花蕊，花瓣的尖部向花蕊的反方向弯曲；而海芋的花则是半鹰嘴形，花瓣的尖部是向花蕊弯曲的，很象是中国神话里的坐莲观音，滴水观音中的观音两字就是由此而来。

花蕊不同：海芋的花蕊要比马蹄莲的花蕊粗壮；海芋花凋谢后会露出红色晶莹的若红色玉米棒般的籽棒，马蹄莲则鲜有结籽。