鱼缸中的氨氮主要靠硝化细菌去除。硝化细菌是一种好氧性细菌，它可以将水中的氨氮转化为亚硝酸盐，之后还能转化为硝酸盐，这样就可以避免鱼儿受到毒害，而且降低了水体的营养，也能防止藻类的爆发，对水质的维持有很大的帮助作用。除此之外，部分藻类也有吸收氨氮的能力。