两个月宝宝总咳嗽，需要查明病因，针对病因应用药物治疗。如果是支气管哮喘的原因造成咳嗽的现象，这种情况是自身免疫系统疾病造成，因此可以采取抗免疫的方法或者抗过敏的方法治疗，也可以应用扩张气管的方法进行治疗。可能是炎症感染的原因造成，这种情况需要查明病原体，并且针对病原体，应用抗生素或者抗病毒的药物进行治疗，并且需要做好对症处理。