龟头起水疱可能是疱疹病毒感染所致，也有可能是龟头炎的症状。当生殖器受到支原体、衣原体、滴虫等病原体感染时，包括龟头在内的生殖器周围皮肤会出现小疱疹，疱疹中含有透明状的液体，同时局部会出现明显的瘙痒、疼痛感，疱疹具有很强的传染性，会通过性生活传播。而龟头炎也是诱发龟头周围起水疱的又一病因，龟头炎是没有做好私处卫生，包皮过长等原因所致。龟头在局部炎症的刺激下局部会出现红肿、瘙痒感，严重时龟头周围会起小水疱。龟头炎发作时要做好个人私处卫生，如果存在包皮过长的现象，需要做包皮环切手术。