抗甲状腺药物半衰期比较长，维持的时间比较长，代谢较慢，所以最佳的吃药时间是早餐前。抗甲状腺药物常用的有甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶。甲巯咪唑是治疗甲亢的首选药物，作用比较强，疗效比较明显，所以适合于长期抗甲状腺药物治疗，能够有效长期的控制甲亢。服用甲巯咪唑不良反应主要有白细胞减少，肝功能损伤。另外，如果有甲亢危象，妊娠期甲亢，首选的药物是丙硫氧嘧啶。