男性衣原体阳性指的是非淋菌性尿道炎，跟包皮过长也是有很大的关系的。首先需要详细的检查一下，根据检查的结果治疗，如果是包皮过长的患者可以积极的手术治疗，同时也要口服抗感染的药物来调理，综合性的治疗才能够达到好的效果，衣原体阳性指的是性疾病，通常通过性传播的。而且在治疗期间不能够性生活避免出现检查感染的情况，治疗一段时间后要进行复查一下，看病情的恢复状态，同时患者要保持好的心情，养成良好的生活习惯，不要和别人同用一条毛巾。