肛周尖锐湿疣的治疗考虑用液氮冷冻和二氧化碳激光去除肉眼可见的疣体，同时可以联合口服转移因子胶囊来提高自身的抵抗力，加强自身对于病毒的清除能力。去除肉眼可见的疣体后可以使用ALA-光动力疗法，治疗后局部可以外涂夫西地酸乳膏或红霉素软膏来保护创面，进一步消除隐匿感染和潜伏感染，减少尖锐湿疣的复发率。一旦发现有复发的疣体应该尽早到医院就医并且进行激光灼烧治疗，在尖锐湿疣的治疗期间要尽量规避危险性行为。