常用的治疗幽门螺杆菌的药物包括PPI类抑酸剂、铋剂类胃黏膜保护剂及抗生素。其中PPI类抑酸剂，常用药有奥美拉唑、雷贝拉唑、埃索美拉唑等。常用的铋剂类胃黏膜保护剂有果胶铋、枸橼酸铋钾等。常用的抗生素有阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑、奥硝唑、左氧氟沙星等。患者需要根据具体的情况，从上述药物中选择相应的药物行根除幽门螺杆菌治疗。